这篇文章主要介绍“怎么用Python对gff3格式进行处理”的相关知识，小编通过实际案例向大家展示操作过程，操作方法简单快捷，实用性强，希望这篇“怎么用Python对gff3格式进行处理”文章能帮助大家解决问题。 从JGI上下载的玉米基因组的注释文件（gff3格式），第一例通常为基因的定位信息。1则表示位于玉米的1号染色体上，第二例表示注释的版本信息，第三列通常为gene，mRNA，CDS等信息，同时一个基因可能对应多个mRNA，对生物有些了解的也知道，一个mRNA即是一个转录信息， 这个和注释过后的序列文件也是一一对应的。第四列和第五列分别为基因的第三列信息在染色体上的物理位置。第七列则表示基因位于正链上还是负链上。第八列是相位信息。第九列则是基因注释的一些ID信息。而本次数据处理主要是提取第一列、第三列、第四列、第五列和第九列的信息。 处理后的格式一共有五列，第一列为基因所在的染色体上，第二列是利用gene的起始位点和终止位点进行排序的逻辑顺序而生成的新的I免费云主机域名D信息，第三列和第四列就是基因的起始位点和终止位点了。第五列就是从原始的注释信息第九列提取出来的，必须个序列文件一一对应才行。下面直接上代码。关于“怎么用Python对gff3格式进行处理”的内容就介绍到这里了，感谢大家的阅读。如果想了解更多行业相关的知识，可以关注百云主机行业资讯频道，小编每天都会为大家更新不同的知识点。
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