本篇内容主要讲解“R语言怎么使用cgdsr包获取TCGA数据”，感兴趣的朋友不妨来看看。本文介绍的方法操作简单快捷，实用性强。下面就让小编来带大家学习“R语言怎么使用cgdsr包获取TCGA数据”吧!众所周知,TCGA数据库是目前最综合全面的癌症病人相关组学数据库，包括的测序数据有：DNA SequencingmiRNA SequencingProtein ExpressionmRNA SequencingTotal RNA SequencingArray-based ExpressionDNA MethylationCopy Number知名的肿瘤研究机构都有着自己的TCGA数据库探索工具，比如：Broad Institute FireBrowse portal, The Broad InstitutecBioPortal for Cancer Genomics, Memorial Sloan-Kettering Cancer CenterTCGA Batch Effects, MD Anderson Cancer CenterRegulome Explorer, Institute for Systems BiologyNext-Generation Clustered Heat Maps, MD Anderson Cancer Center其中cBioPortal更是被包装到R包里面这里介绍如何使用R语言的cgdsr包来获取任意TCGA数据。cgdsr包:R语言工具包，可以下载TCGA数据。
DT包:data.table包，简称DT包，是R语言中的数据可视化工具包。DT包可以将Javascript中的方法运用到R中，也能将矩阵或者数据表在网页中可视化为表格，以及其它的一些功能。上表的cancer_study_id其实就是数据集的名字，我们任意选择一个数据集，比如stad_tcga_pub ，可以查看它里面有多少种样本列表方式。查看任意数据集的数据形式一般来说，TCGA的一个项目数据就几种，如下：样本个数差异很大，不同癌症热度不一样。只需要根据癌症列表选择自己感兴趣的研究数据集即可，然后选择好感兴趣的数据形式及对应的样本量。就可以获取对应的信息：很简单就得到了指定基因在指定癌症的表达量下面的函数，主要是配色比较复杂，其实原理很简单，就是一个热图。到此，相信大家对“R语言怎么使免费云主机域名用cgdsr包获取TCGA数据”有了更深的了解，不妨来实际操作一番吧！这里是百云主机网站，更多相关内容可以进入相关频道进行查询，关注我们，继续学习！
这篇“如何使用vue代码实现记事本功能”文章的知识点大部分人都不太理解，所以小编给大家总结了以下内容，内容详细，步骤清晰，具有一定的借鉴价值，希望大家阅读完这篇文章能有所收获，下面我们一起来看看这篇“如何使用vue代码实现记事本功能”文章吧。具体代码如下样式部…
免责声明：本站发布的图片视频文字，以转载和分享为主，文章观点不代表本站立场，本站不承担相关法律责任；如果涉及侵权请联系邮箱：360163164@qq.com举报，并提供相关证据，经查实将立刻删除涉嫌侵权内容。
微信扫一扫 
