如何使用itol批量修改进化树中的名称及添加分组名称


这篇文章主要为大家展示了“如何使用itol批量修改进化树中的名称及添加分组名称”,内容简而易懂,条理清晰,希望能够帮助大家解决疑惑,下面让小编带领大家一起研究并学习一下“如何使用itol批量修改进化树中的名称及添加分组名称”这篇文章吧。首先来看一下所需要的文件的格式:格式说明:注释文件中以”#”开头的行是注释行,只起说明作用,iTOL不会读取该行的内容。LABELS:注释文件数据类型声明,这里声明数据集是对进化树标签进行修改。SEPARATOR TAB:指定数据分隔符,即数据列与列之间使用Tab分隔。也可指定分隔符为空格,需将”TAB”改为”SPACE”。(建议使用Tab分隔,这样修改的标签中可以使用空格)如果没有特殊设置,以上部分通常不需要改,直接拷贝使用即可。DATA之后的行就是所有标签修改的数据信息。数据分为两列,第一列为进化树枝的原来的名称,第二列是修改后的名称。按照以上格式准备好注释文件,准备好文件后直接将其拖到iTOL进化树展示所在的位置,就能自动修改进化树的标签了。
除此之外,还可以在进化树中添加外部分组名称,同样可以展示样品的更多信息。添加外部标签所需要的注释文件格式如下:格式说明:配置文件中以”#”开头的行是注释行,只起说明作用,iTOL不会读取该行的内容。DATASET_TEXT:配置文件数据类型声明,这里声明数据集是对进化树添加文本信息。SEPARATOR COMMA:指定数据分隔符,即数据列与列之间使用逗号分隔。COLOR,#ff00ff:指定数据集初始颜色,可在后面进行更改。MARGIN 0免费云主机域名:指定外部标签与进化树之间的距离,可为负数,会导致与进化树重叠。LABEL_ROTATION,0指定外部标签的初始角度。如果没有特殊设置,以上部分通常不需要改,直接拷贝使用即可。DATA之后的行就是所有外部分组的数据信息。数据分为七列,第一列为进化树枝节点ID,第二列是外部分组名称,第三列是名称位置:”-1″代表位于外部,第四列是分组名称颜色,第五列是字体设置,第六列是字体大小,最后一列是名称的角度。同样的,按照以上格式准备好注释文件后,直接将其拖到iTOL进化树展示所在的位置,就能自动在进化树中添加外部分组名称了。以上是“如何使用itol批量修改进化树中的名称及添加分组名称”这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!相信大家都有了一定的了解,希望分享的内容对大家有所帮助,如果还想学习更多知识,欢迎关注百云主机行业资讯频道!

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