GEOquery如何读取本地表达矩阵压缩包


这篇文章将为大家详细讲解有关GEOquery如何读取本地表达矩阵压缩包,小编觉得挺实用的,因此分享给大家做个参考,希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获。利用GEOquery包的getGEO()可以进行芯片相关数据的下载,不过,有人反映不少芯片的表达矩阵下载经常出错,可以免费云主机域名通过手动下载的方式将矩阵文件下载到对应的工作路径中:矩阵文件的基本命名格式:GSEXXXXX_series_matrix.txt.gz为了避免手动整理,可以利用getGEO读取本地本地的矩阵文件,例如(以GSE66597为例):可以读取对应的矩阵文件外,还可以将其相关的平台注释信息文件下载到对应的工作目录(保存目录设置成工作目录)。完成本都读取之后可以按照常规方法进行数据的提取和整理。关于“GEOquery如何读取本地表达矩阵压缩包”这篇文章就分享到这里了,希望以上内容可以对大家有一定的帮助,使各位可以学到更多知识,如果觉得文章不错,请把它分享出去让更多的人看到。

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