小编给大家分享一下vcftools如何去除或保留vcf文件中的样品,相信大部分人都还不怎么了解,因此分享这篇文章给大家参考一下,希望大家阅读完这篇文章后大有收获,下面让我们免费云主机域名一起去了解一下吧!vcftools去除或保留vcf文件中的样品vcftools可以去除或保留vcf文件中的样品,用到的选项为–indv 和–remove-indv,指定要从vcf文件中保留或删除的样品。 可以多次使用此选项来指定多个样品。只保留1和10号两个样品,执行以下代码:删除1号样品,执行以下代码:
如果样品较多,也可将样品保存到文件 id.txt 中,每行为一个样品ID,格式如下:然后使用下面两个选项对vcf文件保留或者删除样品。–keep
–remove
代码如下:以上是“vcftools如何去除或保留vcf文件中的样品”这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!相信大家都有了一定的了解,希望分享的内容对大家有所帮助,如果还想学习更多知识,欢迎关注百云主机行业资讯频道!
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