KEGG API的用法是怎样的

KEGG API的用法是怎样的，很多新手对此不是很清楚，为了帮助大家解决这个难题，下面小编将为大家详细讲解，有这方面需求的人可以来学习下，希望你能有所收获。根据提供的kegg 标识符，返回特定的记录，多个标识符之间用+ 连接，一次最多允许10个标识符，格式如下http://rest.kegg.jp/get/dbentries[/option]
dbentries = KEGG database entries of the following database
database = pathway | brite | module | ko | genome | org | vg | ag | compound |
glycan | reaction | rclass | enzyme | network | variant | disease | drug | dgroup | environ | disease_ja | drug_ja | dgroup_ 香港云主机ja | environ_ja | compound_ja
option = aaseq | ntseq | mol | kcf | image | conf | kgml | json共有两种用法第一种用法，不带任何的option, 返回的结果和网页版的结果类似示例：返回hsa:10458基因的信息http://rest.kegg.jp/get/hsa:10458第二种用法，后面加上options 操作，需要注意的是，特定的数据库有特定的option。对于gene 数据库而言，支持 aaseq 和 ntseq, 返回基因的序列
示例：返回基因的核酸序列http://rest.kegg.jp/get/hsa:10458/ntseq对于pathway 数据库而言，支持 image ， conf， kgml ，但是一次只允许查询1条记录
示例： 返回hsa05130的通路图http://rest.kegg.jp/get/hsa05130/image对于 compound, glycan, drus 数据库，支持 images , mcol, kcf 操作，对于images , 一次只允许返回一条记录示例 : 返回 C00002的结构示意图http://rest.kegg.jp/get/C00002/image转换kegg 的ID 和其他数据库的ID
第一种格式，所有记录之间的转换http://rest.kegg.jp/conv/target_db/source_db
(target_db source_db) = (kegg_db outside_db) | (outside_db kegg_db)
For gene identifiers:
kegg_d> = org
org = KEGG organism code or T number
outside_d> = ncbi-geneid | ncbi-proteinid | uniprot
For chemical substance identifiers:
kegg_db = compound | glycan | drug
outside_db = pubchem | chebi示例： human的ncbi entrez ID 和 kegg 的ID 进行转换http://rest.kegg.jp/conv/hsa/ncbi-geneid第二种格式， 某几条记录之间的转换，格式和第一种相同，只不过每次返回几条记录之间的对应关系，多条记录用+ 连接，1次最多允许10条记录示例，查询hsa:10458和 ece:Z5100 两个基因对应的 ncbi protein idhttp://rest.kegg.jp/conv/ncbi-proteinid/hsa:10458+ece:Z5100检索两个数据库之间的关联，共有两种用法第一种，两个数据库之间的关联http://rest.kegg.jp/link/target_db/source_db
target_db = database
source_db = database
database = pathway | brite | module | ko | genome | org | vg | ag | compound |
glycan | reaction | rclass | enzyme | network | variant | disease | drug | dgroup | environ | atc | jtc | ndc | yj | pubmed示例：human 基因和pathway 之间的对应关系http://rest.kegg.jp/link/pathway/hsa第二种，查询某几条记录在两个数据库之间的关联示例：查询hsa:10458和ece:Z5100 两个基因对应的pathway 信息http://rest.kegg.jp/link/pathway/hsa:10458+ece:Z5100查找药物之间的相互作用关系 , URL 格式如下http://rest.kegg.jp/ddi/dbentry
dbentry = Single entry of the following database
database = drug | ndc | yj
可以提供1个药物的ID, 也可以一次提供多个，多个ID 用 + 连接示例 ： 查询和D005664 这种药物存在相互作用的记录http://rest.kegg.jp/ddi/D00564kegg API 允许我们方便的获取各种资源，最大的好处是我们可以通过程序批量下载，比如批量下载一个物种所有的pathway通路图或者kgml 文件。看完上述内容是否对您有帮助呢？如果还想对相关知识有进一步的了解或阅读更多相关文章，请关注开发云行业资讯频道，感谢您对开发云的支持。

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