本篇文章给大家分享的是有关怎样使用R语言利用vcf格式文件计算核苷酸多样性,小编觉得挺实用的,因此分享给大家学习, 香港云主机希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获,话不多说,跟着小编一起来看看吧。如果当前目录下只有vcf格式文件,会遇到报错Failed to open .vcf.gz: could not load index
,可以参考 https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/11945445.html如果当前目录下没有popgenome-vcf
这个目录,还需要新建目录今天参考的文章里写道 In theory, the r PopGenome can read VCF files directly, using the readVCF function. However, because our samples are haploid, we need to use a different function, r readData, which requires a folder with a separate VCF for each scaffold. 这个是为什么呢?这里可以直接统计 转换和颠换的比例这里的指标都是什么意思呢?这里的指标也看不懂是什么意思呀以上就是怎样使用R语言利用vcf格式文件计算核苷酸多样性,小编相信有部分知识点可能是我们日常工作会见到或用到的。希望你能通过这篇文章学到更多知识。更多详情敬请关注开发云行业资讯频道。
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