这篇文章将为大家详细讲解有关如何进行R语言用DNA序列做主成分的分析，文章内容质量较高，因此小编分享给大家做个参考，希望大家阅读完这篇文章后对相关知识有一定的了解。之前也有人留言问过如何用DNA序列做主成分分析，当时我也不知道，但是大体有一个思路 就是先比对，然后把比对的数据转换成通常用的snp数据应该就可以了，但是也仅限于思路，完全不知道如何操作，今天坐车回家，路上无聊，翻了一下电脑上保存的一些资料，发现了一个办法：可以借助R语言的adegenet包，用到的函数是fasta2genlight()The function fasta2genlight extra 香港云主机cts SNPs from alignments with fasta format. 从比对好的fasta文件中提取snp数据adegenet这个包第一使用需要先安装，直接运行如下命令今天的推文使用的数据集是这个包的内置数据集，首先是获取这个数据集的存储路径这个图如果分面画成山脊图的形式可能会更好看，但是自己目前还不知道如何实现这一步的时间可能会比较长关于如何进行R语言用DNA序列做主成分的分析就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，可以学到更多知识。如果觉得文章不错，可以把它分享出去让更多的人看到。
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