如何使用R语言利用SSR数据构建进化树


这期内容当中小编将会给大家带来有关如何使用R语言利用SSR数据构建进化树,文章内容丰富且以专业的角度为大家分析和叙述,阅读完这篇文章希望大家可以有所收获。今天有一位读者留言问有了SSR的数据,如何画树状图?SSR的数据我也是第一次接触,我看了一下他发给我的数据,是csv格式,每行是一个样本,每列是一个位点。位点的取值是0,和1。这种格式好像叫做二进制的格式。就是下面这种第一列是样本名称,后面每一列是一个位点。我搜索了一下相关教程,找到了一个。需要借助ape这个包,如果是第一次使用的话需要先安装后面进化树可视化还需要用到ggtree,如果是第一次使用也要安装BiocManager第一次使用也得先安装找到的教程的链接是 https://www.biostars.org/p/100432/这位读者的数据过多,最后画树状图如果带上样本名字的效果如下这个图应 香港云主机该如何美化我还真没有思路。大家如果做过这种图欢迎留言讨论 如何美化会好看一点我记得好像MEGA也可以利用这种二进制数据构建进化树了,但是一时想不起来如何做了。上述就是小编为大家分享的如何使用R语言利用SSR数据构建进化树了,如果刚好有类似的疑惑,不妨参照上述分析进行理解。如果想知道更多相关知识,欢迎关注开发云行业资讯频道。

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